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Vol. 1 No. 1 (September 2011)
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基于序列关联的蛋白质亚细胞定位识别
Recognition of Subcellular Localization of Proteins Using of Sequences Fusion
DOI:
10.12677/hjcb.2011.11001
,
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HTML
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被引量
下载: 3,517
浏览: 13,380
科研立项经费支持
作者:
贾芸
:
关键词:
亚细胞定位
;
F值
;
二次判别分析
Subcellular Localization; F-Value; Quadratic Discriminant Analysis
摘要:
对未知蛋白的功能注释是蛋白质组学的主要目标。一个关键的注释是蛋白质亚细胞定位的预测。应用基于序列关联的二次判别分析方法进行蛋白质亚细胞定位预测,对4个植物定位类型进行5-fold交叉检验。
Abstract:
Functional annotation of unknown proteins is a major goal in proteomics. A key annotation is the prediction of a protein’s subcellular localization. We used the method of Increment of Diversity with Quad-ratic Discriminant analysis (IDQD) to predict subcellular localization of proteins which are recognized by the four plant categories and three non-plant and obtained accuracy 87.4(±0.5)% and 91.2(±0.2)%, respectively in 5-fold cross-validation test. Our result is better than comparable existing methods.
文章引用:
贾芸. 基于序列关联的蛋白质亚细胞定位识别[J]. 计算生物学, 2011, 1(1): 1-3.
http://dx.doi.org/10.12677/hjcb.2011.11001
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