BR  >> Vol. 2 No. 3 (July 2013)

    SRAP分子技术在植物基因组学研究中的应用
    Application of SRAP Molecular Techniques in Plant Genome Research

  • 全文下载: PDF(243KB) HTML   XML   PP.87-91   DOI: 10.12677/BR.2013.23015  
  • 下载量: 2,346  浏览量: 10,087   国家科技经费支持

作者:  

李彦锦,唐婷婷,刘本文,江 磊,张 磊,李 刚,覃 瑞,刘 虹:中南民族大学南方少数民族地区生物资源保护与综合利用工程中心,武汉

关键词:
SRAP基因组学SRAP优化 SRAP; Genomics; SRAP Optimization

摘要:

SRAP分子标记技术即相关序列扩增多态性分子标记技术,是近年发展起来的一种新型分子标记技术,具有操作简便、共显性高、重复性好、费用低等优点,该技术主要是对基因的编码区进行扩增,定向分析基因的功能序列。SRAP以其独特的引物设计在基因组学上广泛应用于遗传分析、分子遗传图谱的构建以及基因定位与克隆等方面。本文对SRAP的原理特点及其在植物基因组学上的应用进展进行概述。

SRAP is a new type of molecular marker technique developed in recent years with which abbreviated form of a name of sequence-related amplified polymorphism. SRAP has the advantages of easy to operate, low cost, high codominant and high repeatability. The main task of SRAP is to amplify the coding region of gene, and analyze the functional sequence of the gene directionally. It was widely used in genetic analysis, the construction of molecular genetic map, gene mapping and genetic clone because of its unique primer design on genomics. Based on the characteristics of SRAP and its applications in plant genomics, we introducted the principles of SRAP briefly in this paper.

文章引用:
李彦锦, 唐婷婷, 刘本文, 江磊, 张磊, 李刚, 覃瑞, 刘虹. SRAP分子技术在植物基因组学研究中的应用[J]. 植物学研究, 2013, 2(3): 87-91. http://dx.doi.org/10.12677/BR.2013.23015

参考文献

[1] G. Li, C. F. Quiros. Sequence-related amplified polymorphism (SRAP), a new marker system based on a simple PCR reaction to mapping and gene tagging in Brossica. Theoretical and Applied Genetic, 2001, 103: 455-461.
[2] 杨迎花, 李先信, 曾柏全等. 新型分子标记SRAP的原理及其研究进展[J]. 湖南农业科学, 2009, 5: 15-17.
[3] 朱英, 刘永翔, 黄永会等. 白芨属种质资源的SRAP标记分析[J]. 贵州农业科学, 2012, 40(9): 10-13.
[4] 廖诗童, 贤武, 周会等. 不同耐寒甘蔗品种的SRAP 标记分析[J]. 西南农业学报, 2012, 25(4): 1171-1176.
[5] 杨平, 刘仙俊, 刘新春等. 利用SRAP标记研究四川高原青稞育成品种的遗传多样性[J]. 遗传, 2008, 30(1): 115-122.
[6] T. Majid, K. Mahboubeh, B. Ebrahim, et al. Molecular diversity and phylogenetic relationships of Pistacia vera, Pistacia atlan- tica subsp. mutica and Pistacia khinjuk using SRAP markers. Biochemical Systematics and Ecology, 2012, 44: 179-185.
[7] H. S. Mohammad, T. Majid, E. Badraldin, et al. Use of SRAP markers to assess genetic diversity and population structure of wild, cultivated, and ornamental pomegranates (Punica grana- tum L.) in different regions of Iran. Plant Systematics and Evo- lution, 2012, 298(6): 1141-1149.
[8] 林忠旭, 张献龙, 聂以春等. 棉花SRAP遗传连锁图构建[J]. 科学通报, 2003, 48(15): 1676-1679.
[9] 张宇, 于林清, 慈忠玲等. 利用SRAP标记研究紫花苜蓿和黄花苜蓿种质资源遗传多样性[J]. 中国草地学报, 2012, 34(1): 72-75.
[10] 欧阳冬梅, 游永宁, 刘凰等. 莲品种SRAP指纹图谱的构建及遗传多样性分析[J]. 现代园艺, 2012, 2: 16-19.
[11] 陈晖, 陈美霞, 陶爱芬等. 长果种黄麻SRAP标记遗传连锁图谱的构建及3个质量性状基因定位[J]. 中国农业科学, 2011, 44(12): 2422-2430.
[12] 潘俊松, 王 刚, 李效尊等. 黄瓜SRAP遗传连锁图的构建及始花节位的基因定位[J]. 自然科学进展, 2005, 15(2): 167- 172.
[13] 王凤涛, 蔺瑞明, 欧阳宏雨等. 利用SRAP标记分析河南小麦栽培品种的遗传多样性[J]. 植物遗传资源学报, 2009, 10(4): 517-521.
[14] 张安世, 邢智峰, 刘永英等. SRAP分子标记及其应用[J]. 安徽农业科学, 2007, 35(9): 2562-2563.
[15] 张安世, 刘莹, 徐九文等. 北方粳稻SRAP反应体系的建立与优化[J]. 江苏农业科学, 2010, 2: 29-32.
[16] 江磊, 李彦锦, 刘本文等. 红花(Carthamus tinctorius L.)SRAP反应体系建立与优化及对11个红花品种基因组的初步分析[J]. 植物学研究, 2013, 2: 62-66.
[17] 邵清松, 郭巧生, 房海灵等. 药用菊花SRAP-PCR反应体系的优化[J]. 核农学报, 2009, 5: 820-824.
[18] 孙祖霞, 刘兆磊, 陈素梅等. 荷花SRAP-PCR反应体系的优化与确立[J]. 南京农业大学学报, 2011, 34(6): 53-58.
[19] 任羽, 王得元, 张银东等. 辣椒SRAP-PCR反应体系的建立与优化[J]. 分子植物育种, 2004, 2(5): 689-693.
[20] 袁菊红, 权俊萍, 胡绵好等. 石蒜SRAP-PCR扩增体系的建立与优化[J]. 植物资源与环境学报, 2007, 16(4): 1-6.
[21] 权俊萍, 袁菊红, 穆红梅等. 百里香属植物ISSR-PCR和SRAP-PCR体系的确立及优化[J]. 植物资源与环境学报, 2008, 2: 1-8.
[22] 郭大龙, 罗正荣. 部分柿属植物SRAP-PCR反应体系的优化[J]. 果树学报, 2006, 23(1): 138-141.
[23] Z. Sun, Z. Wang, J. Tu, et al. An ultradense genetic recombination map for Brassica napus, consisting of 13551 SRAP markers. Theoretical and Applied Genetics, 2007, 114(8): 1305-1317.
[24] 李小威, 董志敏, 赵洪锟等. 用SSR标记进行野生大豆耐碱基因定位及QTL分析[J]. 吉林农业科学, 2010, 35(03): 15-17, 56.
[25] 赵立强, 潘文嘉, 马继芳等. 一个谷子新抗锈基因的AFLP标记[J]. 中国农业科学, 2010, 43(21): 4349-4355.
[26] 孙正文, 黄兴奇, 李维蛟等. 分子标记技术及其在水稻基因定位上的应用[J]. 基因组学与应用生物学, 2011, 30(1): 78- 86.
[27] Z. Lin, D. He, X. Zhang, et al. Linkage map construction and mapping QTL for cotton fibre quality using SRAP, SSR and RAPD. Plant Breeding, 2005, 124(2): 180-187.
[28] A. Levi, C. E. Thomas, T. Trebitsh, et al. An extended linkage map for watermelon based on SRAP, AFLP, SSR, ISSR, and RAPD markers. Journal of the American Society for Horticul- tural Science, 2006, 131(3): 393-402.
[29] J. J. Lu, H. Y. Zhao, N. N. Suo, et al. Genetic linkage maps of Dendrobium moniliforme and D. officinale based on EST-SSR, SRAP, ISSR and RAPD markers. Scientia Horticulturae, 2012, 137(1): 1-10.
[30] D. W. Xue, S. G. Feng, H. Y. Zhao, et al. The linkage maps of Dendrobium species based on RAPD and SRAP markers. Journal of Genetics and Genomics, 2010, 37(3): 197-204.