基于转录组测序探究BaP暴露对孕早期卵巢黄体衰老的影响
RNA-Seq-Based Technique to Study the Effects of Exposure to Benzoapyrene on Ovarian Corpus Luteum Senescence during Early Pregnancy
DOI: 10.12677/hjbm.2024.142015, PDF, HTML, XML, 下载: 96  浏览: 143 
作者: 王明霞, 陈雪梅*:重庆医科大学公共卫生学院生殖与发育教育部国际合作联合实验室,重庆;徐翰婷:重庆医科大学基础医学院生殖与发育教育部国际合作联合实验室,重庆
关键词: 苯并芘卵巢转录组差异表达基因细胞衰老Benzoapyrene Ovary Transcriptome DEGs Cell Senescence
摘要: 目的:通过转录组测序技术分析孕早期BaP暴露对卵巢黄体的影响。方法:利用雌性SD大鼠构建BaP染毒孕鼠模型,BaP组孕鼠自怀孕第一天(d1)每日晨灌胃给予0.2 mg/(kg/d) BaP,对照组则给予等体积的玉米油,收集d7大鼠卵巢组织。同时利用0.5 µmol/L BaP处理人卵巢颗粒细胞KGN构建细胞模型。利用转录组测序(RNA-seq)技术检测对照组与BaP组卵巢黄体组织中的差异表达基因(DEGs),并进一步对筛选的DEGs进行生物信息学分析和分子功能验证。结果:RNA-seq共筛选出300个差异表达基因,其中上调基因86个,下调基因214个。对DEGs进行GO功能注释和KEGG富集分析,结果显示BaP暴露可能通过细胞衰老信号通路损伤孕早期卵巢功能。β-半乳糖苷酶染色结果显示,与对照组相比,BaP处理组β-半乳糖苷酶活性显著增加;Western blot、免疫组化和免疫荧光结果显示,BaP暴露下调CDK4、CyclinD1的表达,同时上调p53、p21和p16的蛋白水平。结论:BaP暴露诱导卵巢颗粒细胞衰老,进而损伤孕早期大鼠卵巢黄体功能。
Abstract: Objective: The effect of early pregnancy exposure to BaP on the ovarian corpus luteum was analysed by RNA-Seq. Methods: A BaP-contaminated pregnant mice model was constructed using female SD rats. The pregnant rats in the BaP group were given 0.2 mg/(kg/d) BaP by daily morning gavage up from the first day of pregnancy (d1), while the control group was given an equal volume of maize oil, and ovary tissues were collected from d7 rats. Treating human ovarian granulosa cells KGN with 0.5 µmol/L BaP to establish the cell models. The transcriptome sequencing (RNA-seq) technology was used to detect differentially expressed genes (DEGs) in ovarian corpus luteum tissues of the control and BaP groups, and the screened DEGs were further subjected to bioinformatics analyses and molecular functional validation. Results: A total of 300 DEGs were screened by RNA-seq, including 86 up-regulated genes and 214 down-regulated genes. Gene Ontology (GO) functional annotation and KEGG enrichment analyses of DEGs showed that BaP exposure may impair ovarian function in early pregnancy through cellular senescence signalling pathways. The results of β-galactosidase staining showed a significant increase in β-galactosidase activity in the BaP-treated group compared to the control group. Western blot, IHC and IF results revealed that BaP exposure down-regulated the expression of CDK4 and CyclinD1, while up-regulating the protein levels of p53, p21 and p16. Conclusion: BaP exposure might induce ovarian granulosa cell senescence, which leads to impair ovarian luteal function in early pregnancy rats.
文章引用:王明霞, 徐翰婷, 陈雪梅. 基于转录组测序探究BaP暴露对孕早期卵巢黄体衰老的影响[J]. 生物医学, 2024, 14(2): 133-144. https://doi.org/10.12677/hjbm.2024.142015

1. 引言

多环芳烃(Polycyclic aromatic hydrocarbons, PAHs)是有机物不完全燃烧过程中所产生的有毒环境污染物,广泛存在于汽车尾气、香烟烟雾、工业排放物以及碳烤烟熏食品等中 [1] 。其中苯并芘(Benzoapyrene, BaP)是PHAs中最具代表性的一种,具有致癌和致突变性 [2] [3] ,以及明显的发育、神经和生殖毒性等 [4] [5] 。人们在日常生活中主要通过吸入、皮肤接触和食入等方式暴露于BaP [6] 。BaP属于内分泌干扰物,具有明显的卵巢毒性。课题组前期研究发现 [7] ,孕早期暴露于BaP会影响卵巢合成与分泌的雌孕激素,进而影响胚胎植入及子宫内膜蜕膜化过程,干扰妊娠的维持。其中,黄体是卵巢内短暂存在的内分泌腺,具有分泌孕酮以维持妊娠的功能 [8] 。此外,课题组前期研究还证实 [9] ,孕早期暴露BaP会诱导小鼠卵巢组织内活性氧(Reactive oxygen species, ROS)的产生。生理水平的ROS对于正常卵巢功能的调控至关重要,比如参与调节卵泡生长、血管生成和黄体类固醇激素合成等 [10] 。然而,当卵巢暴露于高浓度的氧分子或接触到具有氧化性的化学衍生物时,这些暴露物可损伤卵巢正常生理功能,影响排卵和卵泡质量,或干扰类固醇激素的合成与分泌,甚至引起黄体功能不全(Luteal phase deficiency, LPD)、卵巢早衰(Premature ovarian failure, POF)等疾病的发生 [11] [12] 。研究发现 [13] ,BaP可与小鼠精母细胞DNA反应形成BaP-DNA加合物,通过p53/p21依赖性途径诱导精母细胞衰老。同时,Saha等人也发现 [14] ,BaP暴露能通过诱导ROS的生成从而促进人星形胶质细胞衰老。女性的生育能力主要取决于卵巢寿命,卵巢衰老将会破坏排卵、黄体形成等过程,同时干扰受精、着床和早期胚胎发育这一系列妊娠关键事件,从而损伤女性生育能力或引起不孕症、流产等不良妊娠结局的发生 [15] [16] 。目前BaP暴露所导致的大鼠卵巢黄体功能异常与卵巢细胞衰老之间的关系尚不清楚。因此,本研究旨在从细胞衰老的角度探讨BaP对大鼠卵巢黄体细胞功能的影响,研究结果将为深入探讨BaP影响卵巢功能的机制及更加全面地了解BaP的雌性生殖毒性提供新的思路和见解。

2. 材料和方法

2.1. 实验材料

2.1.1. 实验动物

本实验所用SPF级雌雄SD大鼠(6~8周龄,200~260 g),购于重庆医科大学实验动物中心[实验动物许可号:SCXK (渝) 2007-0002,实验动物使用许可号:SCXK (渝) 2007-0001]。小鼠饲养于温度22 ± 2℃、相对湿度55 ± 10%的环境中,能够自由饮水摄食。本研究符合所在单位实验动物伦理委员会制定的伦理学标准。

2.1.2. 主要试剂

本实验所用到的BaP、玉米油、β-actin抗体、DMEM高糖培养基、两性霉素B均购自美国Sigma公司;细胞衰老β-半乳糖苷酶染色试剂盒、DEPC水、BCA蛋白测定试剂盒、RIPA蛋白裂解液、SDS-PAGE凝胶配置试剂盒、青霉素–链霉素双抗、抗荧光淬灭封片液(含DIPA)均购自上海碧云天生物技术有限公司;SDS-PAGE蛋白上样缓冲液购自新赛美生物科技有限公司;人绒毛膜促性腺激素(hCG)购自美国Millipore公司;胎牛血清购自深圳中科百抗生物技术有限公司;CyclinD1抗体、p16抗体均购自武汉三鹰生物技术有限公司;p21抗体购自武汉华美生物科技有限公司;p53抗体购自CST公司;HRP标记二抗、PBS缓冲液粉末、脱脂奶粉、二步法试剂盒(小鼠/兔增强聚合物法检测系统)均购自北京中杉金桥生物技术有限公司。

2.1.3主要仪器

本研究所使用的仪器主要有:正置显微镜、倒置显微镜(日本Olympus公司),红外荧光化学发光系统(美国Bio-Rad公司),冷冻型高通量组织研磨器(宁波新芝生物科技股份有限公司),多功能酶标仪(美国Molecular Devices公司),激光共聚焦扫描显微镜(日本Nikon公司),移液枪(德国Eppendorf公司)。

2.2. 实验方法

2.2.1. 动物实验与材料收集

将SD大鼠于饲养环境中进行一周的适应性喂养后,于每晚17:00~18:00点按雌雄3:1的比例进行合笼交配。次日晨8时分笼,用棉拭子取阴道分泌物涂片,并将显微镜下观察到精子的雌性SD大鼠进行标记,记录此天为怀孕第一天(孕“d1”天)。将标记后的雌鼠随机分为对照组和BaP组(20只/组)。BaP组孕鼠从孕d1至孕d7天于每日晨体重称量后灌胃给予0.2 mg/kg/d浓度BaP (溶于玉米油内)。而对照组则称重后按0.1 mL/10g动物体重灌胃给予相应体积玉米油。在孕d7天腹腔注射麻醉处死孕鼠后,于冰上迅速分离并收集卵巢组织,并在显微镜下进一步分离黄体组织,用于后续实验。

2.2.2. 细胞培养

本研究所用的人卵巢颗粒细胞系KGN细胞购自美国ATCC公司。KGN细胞在含有100 U/ml青霉素–链霉素、10 U/ml两性霉素B和20%胎牛血清的DMEM-F12的培养基(培养环境:37℃温度、5% CO2浓度)中贴壁生长。将KGN细胞分为对照组、hCG组和BaP组。对照组加入DMSO (终浓度不超过0.1%)作为对照。hCG组:使用hCG (1.0 IU/mL,溶于Hank’s平衡盐溶液中)诱导KGN细胞发生黄体化,处理KGN细胞24 h。BaP组:利用0.5 µmol/L BaP (溶于DMSO中)联合1.0 IU/mL hCG处理KGN细胞24 h,以进行后续实验。

2.2.3. 转录组测序(RNA Sequencing, RNA-seq)

使用TRIzol试剂从收集到的对照组和BaP组大鼠卵巢黄体组织(3个样本/组)中提取总RNA,按送检要求稀释后交由深圳华大基因科技有限公司进行RNA-seq。应用R语言软件分析RNA-seq所获得的数据,筛选对照组与BaP组的差异表达基因(Differential expression gene, DEGs),筛选标准设定为调整P值(Adjusted P value, P adj.) < 0.05,差异倍数(fold change, FC)对数绝对值|logFC| > 2。根据DEGs绘制火山图和聚类热图,分析其分布情况、差异大小及差异显著性等信息;利用数据库基因本体(Gene ontology, GO)和京都基因与基因组百科全书KEGG注释进行功能富集分析。

2.2.4. β-半乳糖苷酶染色法

使用β-半乳糖苷酶染色法检测卵巢组织及KGN细胞内细胞衰老情况。针对于黄体组织,将大鼠卵巢的冰冻切片复温后,使用PBS浸泡洗涤切片,加入100 µl β-半乳糖苷酶染色固定液室温固定20 min;对于KGN细胞,使用HBSS洗涤处理后的KGN细胞,随后加入500 µl β-半乳糖苷酶染色固定液室温固定20 min。最终在固定后的切片及细胞中加入适量配制好的染色工作液,37℃孵育过夜。次日,于显微镜下观察,采集图片。

2.2.5. 蛋白免疫印迹法(Western Blot)

使用RIPA蛋白裂解液提取大鼠卵巢及KGN细胞内的蛋白,利用BCA蛋白浓度测定试剂盒测定蛋白含量,根据酶标仪检测样品的吸光度值计算样品浓度。在提取的蛋白内加入SDS-PAGE上样缓冲液,并放入100℃金属浴内变性10 min,后置于−80℃保存。配置12%分离胶、5%浓缩胶进行上样电泳,将电泳完毕凝胶上的蛋白转印至PVDF膜上。后取出条带,使用5%脱脂奶粉(溶于PBST)于37℃摇床封闭2 h,并于4℃孵育一抗过夜。抗体信息如下:抗p21抗体(1:200)、抗p53抗体(1:1000)、抗p16抗体(1:200)、抗CDK4抗体(1:500)、抗CyclinD1抗体(1:1000)和抗β-actin抗体(1:3000)。次日,用PBST浸洗条带后,加入二抗(1:3000)于37℃孵育1 h,随后使用红外荧光化学发光系统显色。以β-actin为内参,使用Quantity One软件分析显色条带灰度值。

2.2.6. 免疫组化(Immunohistochemistry, IHC)

取大鼠卵巢组织进行石蜡包埋,使用石蜡切片机对包埋组织进行切片,将获得的切片烘干后进行免疫组化实验。将烘干的切片置于二甲苯中脱蜡后,于梯度酒精内脱水,并用枸橼酸盐溶液进行抗原热修复。加入适量的内源性过氧化物酶阻断剂消除切片中的内源性干扰后,孵育一抗(CDK4, 1:100)于4℃过夜。次日,使用PBS洗去切片上过量的抗体后,滴加适量的山羊抗小鼠/兔IgG聚合物37℃孵育20 min,利用DAB进行显色反应。使用中性树胶对切片进行封片,于显微镜下观察,采集图片信息。

2.2.7. 免疫荧光(Immunofluorescence, IF)

将KGN细胞接种于24孔板爬片中,加药处理24 h后弃去培养基。使用PBS浸洗爬片后,利用4%多聚甲醛室温固定爬片上的KGN细胞,后用5%山羊血清封闭液封闭,加入一抗(CDK4, 1:100)于4℃孵育过夜。次日复温后,使用荧光二抗稀释液(1:200)避光孵育1 h,后用含DIPA的抗荧光淬灭剂封片,并于共聚焦显微镜下观察。

2.2.8. 统计学分析

运用GraphPad Prism 7.0软件进行数据统计并绘制统计图,每个实验至少重复3次。计量资料用均数 ± 标准差( X ¯ ± S )表示,分别使用t检验和单因素方差分析对两组和多组数据进行统计分析。p < 0.05表示差异具有统计学意义。

3. 结果

3.1. BaP暴露干扰了孕早期卵巢细胞衰老过程

注:(A) 差异表达基因的火山图。Log2 (foldchange) > 2和p < 0.05的基因分别以蓝色(下调基因)和红色(上调基因)表示。(B) 差异表达基因表达变化的热图。(C) 显著差异表达基因的GO功能富集分析图。橙黄色表示生物学过程(Biological process, BP),深青色表示细胞成分(Cellular component, CC),深蓝色表示分子功能(Molecular function, MF)。

Figure 1. Differentially expressed genes and related pathways in luteal tissue of BaP-treated rat ovaries

图1. BaP处理的大鼠卵巢黄体组织的差异表达基因及相关通路。

注:(A) 差异基因表达气泡图,显示富集的信号通路;(B) 差异基因表达cnetplot图,显示与这些信号通路相关的特定基因。

Figure 2. KEGG functional enrichment analysis of significantly differentially expressed genes

图2. 显著差异表达基因的KEGG功能富集分析

RNA-seq数据集的DEGs分析显示,本次测序共存在有300个基因在对照组和BaP组间存在着差异表达(86个基因上调,214个基因下调),其中p21、p53、Bcl6、Slc34a2、Cdkn2a、Prss35、Cdkn2b等基因表达显著上调,而Akr1c3、Cyp17a1、Ccnd1、Cdk4、Nemp1、Rcan1等基因表达显著下调(图1(A)和图1(B))。随后对BaP组中显著DEGs进行GO功能分析,结果显示DEGs主要聚集在10个显著的GO中,包括调控细胞周期G1/S期的转换、电离辐射反应、细胞衰老和细胞周期阻滞等生物过程(图1(C))。此后,我们进一步对这些DEGs进行了KEGG富集分析,气泡图结果显示这些DEGs主要在细胞衰老、病毒致癌和细胞周期通路中富集,而cnetplot图则显示在这些DEGs中表达上调的p21、p53、Cdkn2a和Cdkn2b,与表达下调的Ccnd1、Cdk4参与了细胞衰老过程的调控(图2)。以上这些结果提示,BaP暴露可能通过干扰细胞衰老相关调控因子表达,损伤孕早期卵巢功能。

3.2. BaP暴露促进孕早期卵巢颗粒细胞衰老

为了明确BaP暴露对孕早卵巢细胞衰老的影响,我们使用β-半乳糖苷酶染色法检测了卵巢组织和体外黄体化KGN细胞内细胞衰老的情况。结果显示,与对照组相比,BaP处理组中β-半乳糖苷酶染色阳性细胞的数量显著增加,且KGN细胞中衰老阳性细胞在BaP处理组中的数量变化趋势与体内趋势相一致(图3)。

注:β-半乳糖苷酶染色检测,(A) 大鼠卵巢组织;(B) KGN细胞内细胞衰老情况。CL:黄体;蓝色标记β-半乳糖苷酶阳性细胞。

Figure 3. Detection of cellular senescence

图3. 细胞衰老情况的检测

3.3. BaP暴露诱导细胞周期阻滞,促进细胞衰老因子的表达

注:用Pathview绘制细胞衰老通路的基因表达图。红色代表上调基因,绿色代表下调基因。

Figure 4. Diagram of cellular senescence signalling pathways

图4. 细胞衰老信号通路图

注:(A) Western blot检测卵巢组织CDK4、CyclinD1、p16、p21和p53的蛋白水平及其灰度分析结果。(B) IHC检测卵巢黄体中CDK4的表达。CL:黄体。**p < 0.01,***p < 0.001,****p < 0.001。

Figure 5. BaP exposure induces cell cycle arrest and cellular senescence in ovarian tissue

图5. BaP暴露诱导卵巢组织细胞周期阻滞和细胞衰老

基于RNA-seq的分析结果,我们绘制了细胞衰老的信号通路图,并根据图1图2中RNA-seq结果在图中标记了衰老相关DEGs的变化情况(图4)。随后,我们进一步验证了BaP处理对这些细胞衰老关键因子的影响。Western blot和IHC结果显示,BaP暴露会下调孕早期大鼠卵巢组织内细胞衰老相关因子CDK4、CyclinD1的表达,同时上调p53、p21和p16的水平(图5)。体外Western blot和IF结果与体内趋势一致,差异有统计学意义(p < 0.05) (图6)。上述实验共同提示,BaP暴露会诱导细胞周期阻滞,促进孕早期卵巢黄体细胞衰老。

注:(A) Western blot检测KGN细胞CDK4、CyclinD1、p16、p21和p53的蛋白水平及其灰度分析结果。(B) IF检测KGN中CDK4的表达。红色表示CDK4阳性细胞,绿色表示标记鬼笔环酰胺染色的细胞骨架,蓝色表示DAPI染色的细胞核。**p < 0.01,***p < 0.001,****p < 0.001。

Figure 6. BaP exposure induces cell cycle arrest and cellular senescence in KGN cells

图6. BaP暴露诱导KGN细胞周期阻滞和细胞衰老

4. 讨论

BaP是一种环境内分泌干扰物,可通过多种途径被人体吸收 [17] 。我们的前期研究发现 [7] ,孕早期暴露BaP减少了维持妊娠所必须的雌、孕激素的合成与分泌。卵巢作为女性体内重要的生殖器官之一,其内短暂性存在的内分泌器官黄体是妊娠期分泌雌孕激素的主要场所,对胎儿的发育起着不可或缺的调控作用 [8] 。但目前关于孕早期BaP暴露影响卵巢黄体功能的机制研究并不深入,仍需进一步探索。因此,本研究中我们结合了生物信息学分析以及体内外实验,进一步探索了BaP暴露对孕早期卵巢黄体的影响。我们分别对对照组及BaP组的大鼠卵巢黄体组织进行了RNA-seq,以探索BaP影响孕早期卵巢黄体功能的潜在机制。RNA-seq分析显示,BaP暴露引起了大鼠卵巢组织内300个基因出现差异表达,其中检测到86个上调基因,214个下调基因。为了揭示这些DEGs的潜在生物学功能,我们选择了表达较为显著的DEGs进行了GO和KEGG富集分析。在GO和KEGG富集分析中,我们发现这些较为显著的DEGs主要参与了细胞衰老信号通路的调控,提示BaP可能通过干扰细胞衰老过程损伤孕早期卵巢黄体功能。

细胞衰老作为信号转导过程中的一种,可受到电离辐射、代谢功能障碍、化疗药物、癌基因的激活或氧化损伤等多因素诱导 [18] ,其主要特征是永久性的细胞周期停滞,并可导致发育过程中及损伤后组织重塑能力下降,促进炎症反应,或诱导衰老生物体的肿瘤发生 [18] [19] [20] 。衰老表型主要包括DNA损伤反应的激活或细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂(如p16、p21等)表达上调,进而导致细胞周期阻滞、产生衰老相关分泌表型(SASP)、衰老相关β-半乳糖苷酶活性增加等 [18] [21] 。同时,衰老信号通路的激活往往会降低细胞周期蛋白依赖性激酶(CDK)的活性 [22] [23] 。而衰老细胞中,p21和p16会与细胞周期蛋白Cyclin-CDK发生抑制性结合,参与细胞周期进展的阻滞,从而进一步促进细胞衰老的发生 [24] [25] 。研究发现 [26] ,在肺癌细胞A549中,BaP通过增加p21的表达抑制了A549的细胞增殖,延迟了细胞周期进程。Yu Feng等人也发现 [27] ,长期暴露于BaP可增加小鼠肺成纤维细胞mLFC中p53和p21蛋白表达水平,诱导mLFC发生衰老。前期关于BaP致卵巢衰老的研究主要集中产前BaP暴露对卵巢功能的影响 [28] [29] 。如,Lim等人研究指出 [29] ,产前BaP暴露会减少小鼠卵巢中卵泡数量,降低卵巢储备能力,导致卵巢在产后出现提前衰老的现象。由于妊娠期间卵巢对BaP的敏感性更高,因此探究BaP暴露对于妊娠期卵巢黄体的影响是非常有必要的。

在本研究中,我们使用β-半乳糖苷酶染色检测发现,BaP暴露会增强大鼠卵巢黄体细胞和黄体化KGN细胞中β-半乳糖苷酶活性。同时,我们还通过Western blot、IHC和IF实验结果验证得出,BaP暴露上调了衰老相关表型如衰老指标p21和p16的表达水平,抑制了细胞周期调控蛋白CDK4和CyclinD1的表达,导致细胞周期阻滞,诱导细胞衰老。综上,我们推测:BaP暴露诱导孕早期卵巢黄体衰老可能是通过促进BaP-DNA加合物形成,导致DNA损伤和激活p53信号通路,进而上调p53下游靶基因p21的表达,造成颗粒细胞细胞周期停滞和细胞衰老的发生。然而本研究依然存在着局限性,未能深入探索BaP激活p53信号通路诱导黄体颗粒细胞衰老确切分子机制,这也是课题组下一步计划研究和完善的重点。综上所述,本研究从卵巢黄体颗粒细胞衰老的角度探讨BaP暴露导致孕早期卵巢黄体功能异常的机制,研究结果为更加全面深入了解BaP影响卵巢黄体功能提供新的方向和线索。

NOTES

*通讯作者Email: chenxuemei@cqmu.edu.cn

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