基本情况

成喜雨,北京交通大学生命科学与生物工程研究院,教授/博导/首批青年英才计划,国家自然科学基金/北京市科委等项目评审专家、雄安新区知识产权协会专家、Space Habitation青年编委等。2011年于中国科学院过程工程所获得生物化工博士学位,之后赴新加坡国立大学从事博士后研究,2013 年加入北京交通大学工作至今。申请人长期从事智能生物交叉、生物信息学与合成生物技术等研究,主持和参与国家自然科学 基金、教育部联合基金、科技委国家级纵向项目、北京市自然科学基金、Singapore-GSK 项目等项目20余项。参与出版中英文专著3本;在Advanced Functional MaterialsEcotoxicology and Environmental SafetyApplied EnergyBioresource Technology《合成生物学》、《前瞻科技》等发表论文近60篇,发表SCI 论文h-因子17;完成原理样机2件,国防科技报告4份;申请发明专利10项。

 

研究领域

围绕医药、环境、能源等领域的生物大数据挖掘、纳微生物材料、生物转化过程及其关键科 学问题,开展智能生物交叉与合成生物研究,主要包括:

生物剂型工程:与中科院过程工程研究所生物药制备与递送全国重点实验室合作,联合开 展多组学与合成生物驱动的重大疾病生物纳米、微生物递送和治疗系统研究。

智能生物交叉:围绕医药、环境、能源等领域重大需求,基于 AI 与生物信息先进技术,开 展功能分子 AI 大模型筛选、生成和理性设计研究,包括抗菌肽、抗肿瘤肽、功能酶与基因 元件等。

环境生物与环境健康:AI+多组学驱动的深空探测生保系统;针对轻工行业、农业、林业生 物质废弃物特点,开展有机废弃物高值化利用研究,进行半纤维素转化低聚木糖-木质素 转化香兰素-纤维素转化可发酵糖的高值化利用;秸秆有机废弃物转化氢气、甲烷、乙醇、 丁醇的资源和能源化利用;重金属污染监测及其人体健康损害风险评估等。

 

教育背景

20059月至20114月 博士,生物化工,中国科学院过程工程研究所

20029月至20057月 硕士,生物化工,北京科技大学

19989月至20027月 学士,化工工艺,湖南科技大学

 

工作经历

20136月至今     教授/博导,生物化工,北京交通大学

20116月至20134月 助研,生物化工,National University of Singapore

 

发表文章和专利申请

部分论文专著:

  1. Zhuang Tian, Chenxi Yu, He Li, Bin Song, Jianwei Lv, Chuang Liu, Wanting Sun, Xiao Hu, Yixi Xiong, Jinlong Liu, Xiyu Cheng *, Maohua Yang *, Jianmin Xing. Heterologous expression of sulfur: quinone oxidoreductase (Sqr) to improve Thioalkalivibrio versutus D301 desulfurization performance. Journal of Applied Microbiology, 2024, 135(9): lxae237.*通讯】
  2. Siyu Gong, Pan Pan, Xiangying Meng, Yuxin Zhang, Hanli Xu, Honggang Hu, Xiyu Cheng*, and Qiong Yan*. Integrated physiologic and proteomic analyses reveal the molecular mechanism of Navicula sp. in response to ultraviolet irradiation stress. International Journal of Molecular Sciences, 2024, 25, 2747.*通讯】
  3. Jinyu Fu, Rurong Mo, Ziyao Li, Shijie Xu, Xiyu Cheng, Binghuai Lu, Shuobo Shi. An extraction-free one-pot assay for rapid detection of Klebsiella pneumoniae by combining RPA and CRISPR/Cas12a. Biosensors & Bioelectronics, 2024, 267:116740.
  4. Xiyu Cheng*, Abdur Rahim Khan, Karima EL Karrach, Feng Wang. Environmental bioremediation: application of enzymes and microbes. Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, 2023, 11:1327124.*通讯】
  5. Xiaoyu Cui, Zhe Zhang*, Bo Zhao, Xiyu Cheng and zhimei Qi. Structural characterization and optical properties of perovskite crystals based on micro-hyperspectral imaging sensor, IEEE Sensors Journal, 2023, Doi:10.1109/JSEN.2023.3330162.
  6. 晏琼, 张金磊, 冯可, 李环宇, 李玥, 成喜雨*. 地外可循环生保系统关键生物技术现状与发展建议. 前瞻科技, 2024, 3(1): 126-136.* 通讯】
  7. Yaping Sun, Xiaoyu Liu,Wenxuan Li, Xinning Wang, Xiaoyue Zhong, Yifan Gao, Hanli Xu, Honggang Hu, Lishu Zhang, Xiyu Cheng*, Qiong Yan*. The regulatory metabolic networks of the Brassica campestris L. hairy roots in response to cadmium stress revealed from proteome studies combined with a transcriptome analysis. Ecotoxicology and Environmental Safety, 2023, 263: 115214.*通讯】
  8. Feng Cao, Xing Lv*, Yixuan Zhou, Xiyu Cheng*. Modified SEIAR infectious disease model for Omicron variants spread dynamics. Nonlinear Dynamics, 2023, 111: 14597–14620*通讯】
  9. Xiaoyu Liu, Wenxuan Li, Menghua Wang, Yushen Cao, Teng Zhang, Honggang Hu, Xiyu Cheng*, Qiong Yan. Establishment of hairy root system of transgenic IRT1 brassica campestris L. and preliminary study of its effect on cadmium enrichment. International Journal of Phytoremediation 2023,2511):1455-1462*通讯】
  10. 史硕博, 张翀, 成喜雨, 邢新会. 挑战造物主: 合成生物学使能工具.合成生物学, doi: 10.12211/2096-8280.2023-012
  11. Peng Ye, Xiyu Cheng*, Guanghui Ma*(马光辉), and Wei Wei*(魏炜). In situ generation of gold nanoparticles on bacteria-derived magnetosomes for imaging-guided starving/chemodynamic/photothermal synergistic therapy against cancer. Advanced Functional Materials , 2022 32: 2110063 *通讯】
  12. Chunming Xu, Yifan Gao, Shanshan He, Kun Luo, Qiong Yan, Xiyu Cheng*. Improved sugar recovery from enzymatic hydrolysis of Miscanthus sinensis by surfactant-mediated alkaline pretreatment. Biomass Conversion and Biorefinery, 2021,4: 1-8*通讯】
  13. Yaping Sun, Qianyun Lu, Yushen Cao, Menghua Wang, Xiyu Cheng* and Qiong Yan*. Comparative Transcriptome Analysis of the Molecular Mechanism of the Hairy Roots of Brassica campestris L. in Response to Cadmium Stress. International Journal of Molecular Sciences, 2020, 21, 180.【通讯】
  14. Xiyu Cheng. Basic Algorithms for Bioinformatics (Chapter 11 of Essential Computing Skills for Biologists. Editor: Wang Z.L., Zhang L.S.), Higher Education Press. Beijing, 2018. 【专著】
  15. Xiyu Cheng. Two-Stage Anaerobic Fermentation for Co-Production of Hydrogen and Methane (Chapter 8 of Gas Biofuels from Waste Biomass: Principles and Advances. Editor: Liu Z.D.). Nova Science Publishers, Inc. USA. 2015. 【专著】

 

专利申请:

  1. 刘春朝,成喜雨. 一种生物、碱复合预处理秸秆纤维原料两步发酵产氢的方法. 授权专利号:ZL 200910235234.3
  2. 刘春朝,成喜雨. 纤维废弃物发酵产氢气和/或甲烷的方法及其装置. 授权专利号:ZL200810246603.4
  3. 刘春朝,成喜雨,王锋. 一种使用有机废弃物制备沼气的装置及其制备方法. 授权专利号:ZL 200710099990.9
  4. 刘春朝,成喜雨. 一种使用生物预处理秸秆发酵制备氢气的方法. 授权专利号:ZL 200710178181.7
  5. 刘春朝,刘瑞,刘英,成喜雨. 一种超声波低频-高频耦合式雾化生物反应器. 申请号:No. 201110052959.6
  6. 成喜雨,晏琼等. 一种脱氮硫碱弧菌 BB01 及其应用. 发明专利号:ZL 2023 1 0035570.3 [7] 成喜雨,张泽华等. 一种宏基因组数据分析系统. 专利申请号:No. 202311286371.6
  7. 徐寒黎,成喜雨等. 一种染色体纯合区域的检测方法、系统及电子设备. 专利申请号:No. 202310026558.6
  8. 徐寒黎,谢玉婷,成喜雨等. 基于低深度测序数据检测基因组纯合区域的方法及系统. 专利申请号:No. 2023104938301
  9. 成喜雨,张泽华等. 一种生物危害大数据分析及监测预警系统. 专利申请号:No. 202510614858.5