氟奋乃静的密度泛函理论研究
Study on Density Functional Theory of Fluphenazine
摘要: 本研究运用了密度泛函理论框架下的B3LYP算法,并在6-31G (d)基组层次上深入探究了氟奋乃静分子的理论特性,成功获取了该分子的稳定结构及对应的红外光谱图。通过对红外光谱的细致分析,我们依据分子振动模式的差异性,将光谱区间划分为三个主要部分:低频区(0~500) cm1、中频区(500~3000) cm1和高频区(3000~4000) cm1三个区域。研究表明,由于简并振动模式的存在以及部分振动模式不具备无红外活性,导致红外光谱图中实际显现的谱线条数少于理论上的简正振动总数。
Abstract: This study uses B3LYP algorithm within the framework of Density Functional Theory (DFT) and conducts an in-depth exploration of the theoretical characteristics of the fluphenazine molecule at the 6-31G(d) basis set level. The stable structural features of the molecule and its corresponding infrared spectrum were successfully obtained. After meticulous analysis of the infrared spectroscopy graph, we divided the spectral range into three main parts based on the differences in molecular vibration modes: the low-frequency region (0~500) cm1, the mid-frequency region (500~3000) cm1 and the high-frequency region (3000~4000) cm1. Due to the existence of degenerate vibrational modes and the lack of infrared activity in some vibrational modes, the actual number of spectral lines displayed in the infrared spectrum is less than the total number of theoretical normal vibrations.
文章引用:刘存海, 柳叶, 周鸣宇, 金靓婕. 氟奋乃静的密度泛函理论研究[J]. 应用物理, 2024, 14(12): 811-822. https://doi.org/10.12677/app.2024.1412087

1. 引言

氟奋乃静(C22H26Cl2F3N3OS),归类于吩噻嗪类哌嗪衍生物家族。作为一种针对多巴胺D1及D2受体具有阻滞效应的物质,并展现出与5-羟色胺(5-HT)受体的高亲和特性,氟奋乃静在精神医学领域,特别是针对单纯性、紧张型及慢性精神分裂症的治疗中,显示出明确的疗效,对患者的情感淡漠、行为退缩等问题进行有效干预,并且在处理恶心与呕吐方面亦有所应用。尽管氟奋乃静在医学实践中展现出的治疗效果普遍得到肯定,但其应用也伴随着一定的争议与挑战。特别是,使用该药物后,患者可能出现一系列椎体外系反应,包括但不限于眼球斜视或固定向外上方、肢体异常扭转、角弓反张姿态、颈部僵硬、斜颈现象、无法静坐、肌肉抽搐以及舌根僵硬等运动功能障碍。为了缓解或预先防止这些副作用的出现,临床实践中常考虑联合使用抗震颤麻痹药物。近年来,科研界对氟奋乃静的兴趣持续升温,研究视角广泛而深入,不仅聚焦于其药理机制的深入剖析,还涵盖了其在不同临床情境下的应用实践,以及与其他药物间复杂相互作用关系的探索[1]-[3]。这些研究为氟奋乃静的更安全、有效使用提供了宝贵的科学依据。

本文基于密度泛函理论[4]-[7],对氟奋乃静分子的结构特征和红外振动光谱的分布规律进行了详细分析,有助于全面了解其各类药理特性,更深入地洞察精神疾病的起源与演变历程,为新药研发提供理论依据。

2. 计算方法

运用GaussView分子构型构建软件,成功建构了氟奋乃静分子的结构模型,运用Gaussian09这一计算平台,依据B3LYP方法与6-31G (d)基组设定进行深入的运算分析,对初步构建的分子结构进行了全面且细致的优化,并同步执行了频率分析步骤,确保未检测到任何虚频,从而有力地证明了所得分子构型的稳定性。通过深入剖析了频率计算的结果,我们成功地获得了氟奋乃静分子的红外振动光谱图。针对该光谱中清晰展现的每一条谱带,我们都进行了详尽的识别与解析,并深入探讨了这些谱线形成的潜在机理。为了增强频率计算的精准度至更高水平,采纳0.9613的修正因子[8]进行了修正。

3. 结果与讨论

3.1. 氟奋乃静分子的结构

氟奋乃静分子的稳定构型如图1所示。表1中详细列出了氟奋乃静分子的各项结构特征参数。根据计算结果,氟奋乃静分子的整体构型呈现出良好的对称性,该分子的构成中囊括了七种不同的化学键类型,具体包括C-C键、H-C键、C-N键、S-C键、F-C键、O-C键及H-O键。在C-C键中,发现链式结构中的C-C键较长,而25C-22C的键长为1.531 Å,48C-45C的键长为1.528 Å,28C-25C的键长为1.530 Å;而在由39N和40N所在的环状结构中,33C-31C的键长最长,达到1.522 Å,这也是整个分子中四个环状结构中最长C-C键;此外,35C-32C的键长为1.521 Å。在由20S和21N所构成的环状结构中,13C-11C和3C-2C的键长分别为1.398 Å和1.394 Å;而在14C所在的环状结构中,14C-12C键长最长,为1.388 Å,12C-13C键长为1.386 Å,值得注意的是,17C-14C和16C-13C键长相同,均为1.381 Å;同时,三氟甲基与环状结构所形成的53C-14C键长为1.503 Å;另外,在5C所在的分子结构中,4C-3C键长最长,为1.390 Å,5C-4C键长为1.386 Å。在H-C键中,呈现出一定的规律性。具体而言,30H-28C键长最长,为1.096 Å,在含17C的环状结构中,18H-16C键长相对较长,为1.074 Å,而15H-12C和19H-17C的键长均为1.072 Å;在含5C的环状结构中,除8H-4C Å键长为1.073 Å外,其余10H-6C、7H-1C和9H-5C三个H-C键长均为1.075 Å;在含40N的环状结构中,41H-32C和43H-31C键长均为1.094 Å,也是该环状结构中最长的H-C键;在链式结构中的H-C键中,30H-28C的键长最长,为1.096Å,50H-48C和49H-48C键长均为1.088 Å,46H-45C和47H-45C键长均为1.085 Å,最短H-C键为24H-22C,为1.080 Å。在C-N键中,22C-21N键长最长,为1.456 Å,而11C-21N键最短,为1.408 Å;45C-40N和35C-40N的键长均为1.448 Å。此外,分子中仅含有两个20S-13C和20S-2C S-C键,键长分别为1.773 Å和1.776 Å。在F-C键中,56F-53C键长最长为1.322 Å,54F-53C和55F-53C键长均为1.325 Å。同时,分子结构中还分别包含一个O-C键和一个H-O键,键长分别为1.405 Å和0.946 Å。

Figure 1. Stable structure of fluphenazine

1. 氟奋乃静分子的稳定构型

在探讨该分子各原子间的键角分布时,∠27H-25C-22C、∠29H-28C-25C、∠44H-33C-31C、∠42H-35C-32C、∠47H-45C-40N以及∠46H-45C-40N均约为108˚,显示出较强的结构稳定性。而∠52H-51O-48C、∠40N-35C-32C以及∠30H-28C-25C与之略有增加,约为110˚,这可能与局部电子云分布或空间位阻效应有关。此外,结构中一些键角展现出更大的偏离,如55F-53C-14C、54F-53C-14C、23H-22C-21N以及56F-53C-14C,这些键角均约为112˚,可能反映了分子中特定官能团或取代基的影响。最后,键角如53C-14C-12C、9H-5C-4C、7H-1C-2C以及18H-16C-13C,它们均接近119˚,这一角度接近理想平面三角形的内角,表明这些原子可能位于一个相对平坦的分子平面上。各二面角中,∠24H-22C-21N-11C、∠28C-25C-22C-21N、∠39N-28C-25C-22C、∠53C-14C-12C-11C和∠56F-53C-14C-12C均为180˚;∠4C-3C-2C-1C、∠5C-4C-3C-2C、∠6C-5C-4C-3C、∠7H-1C-2C-3C和∠9H-5C-4C-3C等12个二面角均为0˚,间接表明氟奋乃静分子构型的良好对称性。

Table 1. Structure parameters of fluphenazine

1. 氟奋乃静分子的结构参数

键长(Å)

键角(˚)

二面角(˚)

2C-1C

1.384

3C-2C-1C

121

4C-3C-2C-1C

0

3C-2C

1.394

4C-3C-2C

118

5C-4C-3C-2C

0

4C-3C

1.390

5C-4C-3C

121

6C-5C-4C-3C

0

5C-4C

1.386

6C-5C-4C

121

7H-1C-2C-3C

0

6C-5C

1.383

7H-1C-2C

119

8H-4C-3C-2C

-177

7H-1C

1.075

8H-4C-3C

120

9H-5C-4C-3C

0

8H-4C

1.073

9H-5C-4C

119

10H-6C-5C-4C

0

9H-5C

1.075

10H-6C-5C

121

11C-3C-2C-1C

-157

10H-6C

1.075

11C-3C-2C

96

12C-11C-3C-2C

148

12C-11C

1.386

13C-11C-3C

95

14C-12C-11C-3C

-144

13C-11C

1.398

14C-12C-11C

121

15H-12C-11C-3C

36

14C-12C

1.388

15H-12C-11C

120

16C-13C-11C-3C

157

15H-12C

1.072

16C-13C-11C

121

17C-14C-12C-11C

0

16C-13C

1.381

17C-14C-12C

121

18H-16C-13C-11C

0

17C-14C

1.381

18H-16C-13C

119

19H-17C-14C-12C

0

18H-16C

1.074

19H-17C-14C

121

20S-13C-11C-3C

-25

19H-17C

1.072

20S-13C-11C

118

21N-11C-3C-2C

-140

20S-13C

1.773

21N-11C-3C

32

22C-21N-11C-3C

-159

21N-11C

1.408

22C-21N-11C

120

23H-22C-21N-11C

64

22C-21N

1.456

23H-22C-21N

112

24H-22C-21N-11C

180

23H-22C

1.089

24H-22C-21N

107

25C-22C-21N-11C

-61

24H-22C

1.080

25C-22C-21N

113

26H-25C-22C-21N

64

25C-22C

1.531

26H-25C-22C

111

27H-25C-22C-21N

-53

26H-25C

1.083

27H-25C-22C

108

28C-25C-22C-21N

180

27H-25C

1.084

28C-25C-22C

111

29H-28C-25C-22C

-53

28C-25C

1.530

29H-28C-25C

108

30H-28C-25C-22C

63

29H-28C

1.086

30H-28C-25C

110

31C-28C-25C-22C

156

30H-28C

1.096

31C-28C-25C

100

32C-31C-28C-25C

150

33C-31C

1.522

34H-31C-28C

89

35C-32C-31C-28C

-158

34H-31C

1.082

35C-32C-31C

90

36H-32C-31C-28C

-34

35C-32C

1.521

36H-32C-31C

144

37H-33C-31C-28C

0

36H-32C

1.085

37H-33C-31C

109

38H-35C-32C-31C

-148

37H-33C

1.085

38H-35C-32C

109

39N-28C-25C-22C

180

38H-35C

1.085

39N-28C-25C

113

40N-35C-32C-31C

-29

39N-28C

1.451

40N-35C-32C

110

41H-32C-31C-28C

93

40N-35C

1.448

41H-32C-31C

94

42H-35C-32C-31C

95

41H-32C

1.094

42H-35C-32C

108

43H-31C-28C-25C

-118

42H-35C

1.093

43H-31C-28C

94

44H-33C-31C-28C

-63

43H-31C

1.094

44H-33C-31C

108

45C-40N-35C-32C

-167

44H-33C

1.093

45C-40N-35C

116

46H-45C-40N-35C

171

45C-40N

1.448

46H-45C-40N

108

47H-45C-40N-35C

56

46H-45C

1.085

47H-45C-40N

108

48C-45C-40N-35C

-67

47H-45C

1.085

48C-45C-40N

117

49H-48C-45C-40N

60

48C-45C

1.528

49H-48C-45C

111

50H-48C-45C-40N

-60

49H-48C

1.088

50H-48C-45C

111

51O-48C-45C-40N

0

50H-48C

1.088

51O-48C-45C

106

52H-51O-48C-45C

0

51O-48C

1.405

52H-51O-48C

110

53C-14C-12C-11C

180

52H-51O

0.946

53C-14C-12C

119

54F-53C-14C-12C

-41

53C-14C

1.503

54F-53C-14C

112

55F-53C-14C-12C

78

54F-53C

1.325

55F-53C-14C

112

56F-53C-14C-12C

180

55F-53C

1.325

56F-53C-14C

112

56F-53C

1.322

3.2. 氟奋乃静分子的红外振动光谱

红外振动光谱的形成根源在于分子内部电子在振动能级之间的跃迁过程。光谱中谱线的强度直接关联于电子跃迁的概率,这一概率又紧密依赖于跃迁过程中所涉及的偶极矩的数值。红外振动光谱的强度大小取决于由振动所导致的偶极矩变动幅度。在振动进程中,若偶极矩发生较大幅度的变化,则会促使电子跃迁的几率增加,进而增强光谱的强度表现。相反地,若分子在振动过程中偶极矩的变化幅度较小,电子跃迁的几率则会相应减小,从而使得红外光谱的强度展现出较弱的特点[8]

Figure 2. Infrared spectrum of fluphenazine

2. 氟奋乃静分子红外光谱

图2为计算所得氟奋乃静的红外振动光谱。经过我们的深入探究,发现尽管分子存在大量的简正振动,但在光谱中观测到的谱线条数却相对较少。这一现象的产生,主要是因为部分振动模式未能导致分子偶极矩发生显著变化,因此这些模式在红外光谱中并不活跃,即缺乏红外活性。此外,简并效应也是造成谱线条数减少的一个重要因素。基于分子振动的不同特性,我们可以将氟奋乃静的红外振动光谱划分为三个主要区域进行进一步探讨:即低频区(0~500) cm1、中频区(500~3000) cm1和高频区(3000~4000) cm1

在红外光谱的低频范围(0~500) cm1内,光谱的整体强度较为微弱。这一区域内的振动模式主要涉及分子内部基团的整体旋转、摆动以及环状结构的呼吸振动。具体而言,最强的振动特征出现在296 cm1处,它主要源于52H的摆动振动,如图3所示。次强峰则位于89 cm1,其对应的分子振动模式如图4描绘,表现为包含48C的CH2基团的整体摆动。此外,在400 cm1处,由28C、32C和33C的CH2基团的整体旋转构成的复合振动产生了一个显著的共振峰。而在384 cm1位置,含28C的整体摆动与含5C环状结构的呼吸振动共同形成了一个较强的谱峰。在346 cm1处,共振峰则是由含20 S环状结构的呼吸与含53C的CF3基团的整体摆动组合而成。另外,在380 cm1处观察到的共振峰与分子结构中的四个环状结构的呼吸振动相对应。同时,含有28C的CH2基团的整体转动和整体摆动分别在430 cm1和322 cm1处形成了共振峰,其中430 cm1处的共振峰强度更为显著。然而,在9 cm1、40 cm1、191 cm1和306 cm1等位置,我们发现了无红外活性的现象。例如,9 cm1处的共振峰对应于含40N的环状结构的呼吸振动,而40 cm1处的共振峰则与含53C的CF3基团的整体转动相关。此外,在48 cm1位置,我们观察到了双重简并现象,其对应的分子振动模式分别为含25C的CH2基团的整体转动和50H的摇摆振动。

Figure3. 296 cm−1 vibration mode

3. 296 cm−1振动模式

Figure 4. 89 cm−1 vibration mode

4. 89 cm−1振动模式

Figure 5. 1346 cm1 vibration mode

5. 1346 cm−1振动模式

Figure 6. 1486cm−1 vibration mode

6. 1486 cm−1振动模式

Figure 7. 1497 cm−1 vibration mode

7. 1497 cm−1振动模式

Figure 8. 1593 cm−1 vibration mode

8. 1593 cm−1振动模式

Figure 9. 3144 cm−1 vibration mode

9. 3144 cm−1振动模式

Figure 10. 3245 cm−1 vibration mode

10. 3245 cm−1振动模式

Figure 11. 3285 cm−1 vibration mode

11. 3285 cm−1振动模式

Figure12. 3617 cm−1 vibration mode

12. 3617 cm−1振动模式

在红外光谱的中频范围(500~3000) cm1内,分子的振动模式主要集中在弯曲振动和摇摆振动上,这些振动可以进一步细分为面内弯曲、面外弯曲、面内摇摆和面外摇摆振动。该区域内存在大量的无红外活性振动模式。在这一频段中,最为显著的振动特征出现在1346 cm1处,如图5所示,这一强峰是由多种振动模式复合而成的,包括19H的摇摆振动、含22C的CH2基团的面外弯曲振动(剪式)、含28C的CH2基团的面外弯曲振动(剪式)以及含32C的CH2基团的面外摇摆振动。此峰不仅是该区域的最强峰。如图6所示,次强峰位于1486 cm1,其主要振动模式为9H、18H和19H的摇摆振动复合而成。此外,在1497 cm1处,38H和42H的面内弯曲振动形成了一个较强的共振峰,如图7所示。而在1642 cm1处,共振峰则是由含22C的CH2基团的面外摇摆振动和含31C的CH2基团的面外弯曲振动共同引起的。同时,含53C的CH3基团的弯曲振动(伞状)在1310 cm1处产生了一个较强的共振峰。其他值得注意的振动特征包括:24H、55F和44H的摇摆振动复合振动在1373 cm1处形成共振峰;46H的摇摆振动与29H和30H的面内弯曲振动复合在1495 cm1处产生共振峰;8H、34H、44H和46H的摇摆振动复合在1593 cm1处形成共振峰,如图8所示;54F和56F的面内弯曲在1567 cm1处产生共振峰;34H和43H的剪式振动以及23H和24H的面外摇摆振动在1396 cm1处形成共振峰。此外,我们还观察到了一些简并现象。在1377 cm1和1251 cm1处分别出现了三重简并,对应的振动模式分别为46H的摇摆振动、37H和44H的剪式振动以及29H和30H的面内弯曲振动。在1288 cm1处出现了双重简并,振动模式为CF3基团的弯曲振动(伞状)与7H的摇摆振动复合,以及30H的摇摆振动。同时,我们也发现了一些无红外活性的振动模式,如864 cm1、980 cm1、1111 cm1、1088 cm1和1157 cm1等位置的共振峰,这些无活性振动模式分别对应于不同的分子振动组合,如55F和44H的摇摆振动、52H和7H的摇摆振动、26H和27H的面外摇摆振动与55F和56H的面内弯曲振动复合、8H的摇摆振动以及49H的摇摆振动等。

在红外光谱的高频区域(3000~4000) cm1内,谱线强度相对较高,该区域内的分子振动模式以伸缩振动为主导,其包含了两种形式,即对称和反对称。尽管此区域的共振峰整体强度相较于其他区域稍弱,然而仍存在一些明显的振动特性。最为突出的振动峰位于3144 cm−1,如图9所示,这一特征是由42H和44H的伸缩振动共同引发的。紧随其后的是位于3245 cm−1的次强峰,其振动模式主要为37H和38H的伸缩振动,具体如图10。此外,在3270 cm−1处,我们观察到了一个由46H和47H的反对称伸缩振动引起的较强共振峰。而在3285 cm−1位置,27H和34H的伸缩振动则形成了一个共振峰,其振动模式如图11所示。值得注意的是,49H和50H的对称伸缩振动在3617 cm−1处产生了一个较强的振动峰,具体振动模式如图12所示。另外,我们还发现54F和56H的反对称伸缩振动在3215 cm−1处形成了一个共振峰。同时,含6C环状结构中的7H、9H和10H的伸缩振动在4118 cm−1处引发了一个较强的振动峰。此外,36H和41H的对称伸缩振动和反对称伸缩振动分别在3248 cm1和3302 cm−1处形成了两个共振峰,但3248 cm1处的共振峰更为显著。

4. 结论

本文致力于探索氟奋乃静分子的结构特征及其红外振动光谱的规律性分布。通过细致的研究,我们发现该分子展现出良好的结构对称性,其红外振动光谱可以清晰地划分为低频、中频和高频三个区域。在低频区,红外光谱强度较低,振动形式包括分子基团的整体旋转、摆动,以及环状结构的呼吸振动。在中频区,红外振动光谱强,振动模式则转变为弯曲振动和摇摆振动,且该区域包含了光谱中的最强峰和次强峰。至于高频区,则以C-H和C-F键的伸缩振动为主导。此外,光谱中各谱峰一般均为多种振动模式复合引起地。同时,我们还注意到了红外光谱中存在的简并振动和无红外活性现象。这些发现为深入理解氟奋乃静分子的结构特性及其红外振动光谱提供了宝贵的见解。

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