《药物化学》期刊论文已被以下数据库收录：
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在RCCSE《中国学术期刊评价研究报告（第七版）》中，本刊被评为“RCCSE中文OA学术期刊类核心期刊”。核心学术期刊证书 中国科教评价网期刊收录信息
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截至2023年6月，据谷歌学术统计，HJMCe《药物化学》期刊文章已被引用，引用次数为10次。文章引用详情可咨询 Index@hanspub.org。
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截至2025年5月，据维普中文期刊服务平台统计，《药物化学》期刊文章被引量：105，H指数：4。
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